Diskussion:DNA-Extraktion

DNA - Phosphorribose?

DNA = Desoxyribonukleinsäure -> Desoxyribose im Rückrad Phospor ist zwar das Zentralatom des Phosphats, jedoch ist das Rückrad der DNA aus Phosphat und dem Zucker Desoxyribose zusammengesetzt. (nicht signierter Beitrag von 84.130.65.223 (Diskussion) 21:38, 21. Feb. 2014 (CET))

Phosphoribosyl ist ein häufig verwendeter Terminus,[1] auch wenn er ungenau ist. Der Begriff wurde auf Deinen Hinweis hin nun präzisiert. Bezüglich Deiner Änderungen zur DNA in der wässrigen Phase, das mögest Du bitte belegen. Gruß, --Ghilt (Diskussion) 00:01, 22. Feb. 2014 (CET)

Da es hier um DNA-Aufreinigung geht sollte davon ausgegangen werden das kein saurer pH verwendet wird und DNA somit in dier wässrigen Phase gelöst ist, standart ist TE Puffer(8.0)- oder MilliQ- gelöste DNA für die Aufreinigung zu verwenden, ebenso wie Phenol:Chloroform-Gemische die unterschiedlich eingestellt sind(TE basiert für DNA Ex, wasserbasiert für RNA Ex). Bei RNA-Aufreinigung wird ein saurer pH (4,8) verwendet um die DNA in der wässrigen Phase zu reduzieren, diese befindet sich dann tatsächlich in der Interphase. Kirby et al 1956, Brawermann et al 1972, Grassmann und Deffner 1953 (nicht signierter Beitrag von 80.187.103.21 (Diskussion) 00:22, 27. Feb. 2014 (CET))

Die im Text zitierte Methode von Sacchi mit Trizol, welche auch die meistverwendete ist,[2] besitzt einen sauren pH-Wert.[3] Kirby war der Erste, der Phenol (zu 90% mit Wasser) zur RNA-Extraktion verwendete,[4] RNA ist hier jedoch nicht das Thema. Bei Kirby war die DNA zudem im Niederschlag. Neuere Literatur (nach 1980) wäre m.E. empfehlenswert, wenn Du einen heutigen Bezug herstellen möchtest. DNA ist aufgrund einer fehlenden Hydroxygruppe unpolarer als RNA und daher eher in einer organischen Phase zu finden als RNA. Wasser/TE kommt m.E. erst im letzten Schritt nach der Ethanolfällung vor. Meistens wird DNA jedoch per Trizol aus Zellen isoliert, bei Säugerzellen herrscht davor pH7-7,2, z. B. Zellen in PBS. Die DNA wird nicht durch pH-Änderungen in der wässrigen Phase reduziert, nur ihre Menge. Gruß, --Ghilt (Diskussion) 09:25, 27. Feb. 2014 (CET)