Leber-Phosphofructokinase
Die Phosphofructokinase, liver type (zu deutsch Phosphofructokinase Typ Leber, PFKL) ist ein Enzym, das die Leber (L)-Untereinheit des tetrameren Enzyms Phosphofructokinase 1 bildet und den geschwindigkeitsbestimmenden Schritt der Glykolyse katalysiert, nämlich die Umwandlung von D-Fructose-6-phosphat zu D-Fructose-1,6-bisphosphat.[1] PFKL wird durch das gleichnamige PFKL-Gen, welches sich beim Menschen auf Chromosom 21 befindet, codiert.
| Phosphofructokinase, liver type | ||
|---|---|---|
| Andere Namen |
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| Eigenschaften des menschlichen Proteins | ||
| Masse/Länge Primärstruktur | 780 Aminosäuren, 85018 Da (Isoform 1) | |
| Bezeichner | ||
| Gen-Name | PFKL | |
| Externe IDs | ||
| Enzymklassifikation | ||
| EC, Kategorie | 2.7.1.11 | |
| Vorkommen | ||
| Homologie-Familie | Hovergen | |
| Orthologe | ||
| Mensch | Hausmaus | |
| Entrez | 5211 | 18641 |
| Ensembl | ENSG00000141959 | ENSMUSG00000020277 |
| UniProt | P17858 | P12382 |
| Refseq (mRNA) | NM_001002021 | NM_008826 |
| Refseq (Protein) | NP_001002021 | NP_032852 |
| Genlocus | Chr 21: 44.3 – 44.33 Mb | Chr 10: 77.99 – 78.01 Mb |
| PubMed-Suche | 5211 | 18641
|
Struktur
BearbeitenGen
BearbeitenDie mRNA-Sequenz von PFKL umfasst 55 Nucleotide an den 5′- und 515 Nucleotide an den 3′-nicht-codierenden Regionen sowie 2337 Nucleotide in der codierenden Region, die 779 Aminosäuren codieren. Diese codierende Region weist nur eine Ähnlichkeit von 68 % zwischen PFKL und der muskulären PFK auf.[2]
Protein
BearbeitenDas 80 kDa schwere Protein ist einer von drei Untereinheitstypen, welche die fünf tetrameren PFK-Isozyme bilden. Die Leber-PFK (PFK-5) enthält ausschließlich PFKL, während die Erythrozyten-PFK fünf Isozyme enthält, die aus verschiedenen Kombinationen von PFKL und dem zweiten Untereinheitstyp, PFKM, zusammengesetzt sind.[3][4] Die Untereinheiten entwickelten sich aus einem gemeinsamen prokaryotischen Vorfahren durch Genduplikation und Mutationsereignissen. Im Allgemeinen führt der N-Terminus der Untereinheiten ihre katalytische Aktivität aus, während der C-Terminus allosterische Ligandenbindungsstellen enthält.[5]
Funktion
BearbeitenDas PFKL-Gen codiert für eine von drei Proteinuntereinheiten der PFK, die exprimiert und gewebespezifisch zum tetrameren PFK zusammengefasst werden. Als PFK-Untereinheit ist PFKL an der Katalyse der Phosphorylierung von Fructose-6-phosphat zu Fructose-1,6-bisphosphat beteiligt. Diese irreversible Reaktion ist der wichtigste geschwindigkeitsbestimmende Schritt der Glykolyse.[3][6] Es wurde gezeigt, dass ein Knock-down von PFKL die Glykolyse beeinträchtigt und den Metabolismus über den Pentosephosphatweg fördert. Darüber hinaus reguliert PFKL die NADPH-Oxidaseaktivität über den Pentosephosphatweg abhängig von der NADPH-Konzentration.[7]
PFKL wurde auch in Leukozyten, Nieren und Gehirn nachgewiesen.[8]
Klinische Bedeutung
BearbeitenDa die Erythrozyten-PFK sowohl aus PFKL als auch aus PFKM besteht, wird diese heterogene Zusammensetzung mit der unterschiedlichen PFK-Aktivität und Organbeteiligung in Verbindung gebracht, die in einigen erblichen PFK-Mangelzuständen beobachtet werden, in denen eine Myopathie, eine Hämolyse oder beides auftreten kann, wie bei der Glykogenspeicherkrankheit Typ VII, ebenfalls bekannt als Tarui-Krankheit.[3][4]
Die Überexpression von PFKL wurde mit Erythrozyten und Fibroblasten des Down-Syndroms und mit biochemischen Veränderungen der PFK in Verbindung gebracht, die ihre glykolytische Funktion verbessern. Darüber hinaus ist das PFKL-Gen auf der für das Down-Syndrom verantwortlichen dreifachen Region von Chromosom 21 abgebildet, was darauf hinweist, dass auch dieses Gen dreifach aufgetreten ist.[9]
Tiermodell
BearbeitenBei der Untersuchung der PFKL-Funktion wurden Modellorganismen verwendet. Eine konditionelle Knockout-Mauslinie mit der Bezeichnung Pfkltm1a(EUCOMM)Wtsi[10][11] wurde im Rahmen des International Knockout Mouse Consortium-Programms entwickelt.[12][13]
Männliche und weibliche Tiere wurden einem standardisierten phänotypischen Screening unterzogen, um die Auswirkungen der Deletion zu bestimmen.[14][15] 26 Tests wurden an mutierten Mäusen durchgeführt und drei signifikante Abnormalitäten wurden beobachtet.[14] Während der Trächtigkeit wurden nur wenige homozygote mutierte Embryonen identifiziert und keine überlebte bis zum Absetzen. Die restlichen Tests wurden an heterozygoten mutierten erwachsenen Mäusen durchgeführt und es wurde ein Phänotyp der Haarfollikel-Degeneration beobachtet.[14]
Einzelnachweise
Bearbeiten- ↑ Mara Dierssen, Rafa de la Torre: Down Syndrome: From Understanding the Neurobiology to Therapy. Band 197. Elsevier, 2012, ISBN 978-0-444-54299-1, S. 184 (eingeschränkte Vorschau in der Google-Buchsuche).
- ↑ D. Levanon, E. Danciger, N. Dafni, Y. Bernstein, A. Elson, W. Moens, M. Brandeis, Y. Groner: The primary structure of human liver type phosphofructokinase and its comparison with other types of PFK. In: DNA. Band 8, Nummer 10, Dezember 1989, S. 733–743, doi:10.1089/dna.1989.8.733, PMID 2533063.
- ↑ a b c S. Vora, C. Seaman, S. Durham, S. Piomelli: Isozymes of human phosphofructokinase: identification and subunit structural characterization of a new system. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. Band 77, Nummer 1, Januar 1980, S. 62–66, doi:10.1073/pnas.77.1.62, PMID 6444721, PMC 348208 (freier Volltext).
- ↑ a b S. Vora, M. Davidson, C. Seaman, A. F. Miranda, N. A. Noble, K. R. Tanaka, E. P. Frenkel, S. Dimauro: Heterogeneity of the molecular lesions in inherited phosphofructokinase deficiency. In: The Journal of clinical investigation. Band 72, Nummer 6, Dezember 1983, S. 1995–2006, doi:10.1172/JCI111164, PMID 6227635, PMC 437040 (freier Volltext).
- ↑ A. Brüser, J. Kirchberger, M. Kloos, N. Sträter, T. Schöneberg: Functional linkage of adenine nucleotide binding sites in mammalian muscle 6-phosphofructokinase. In: Journal of Biological Chemistry. Band 287, Nummer 21, Mai 2012, S. 17546–17553, doi:10.1074/jbc.M112.347153, PMID 22474333, PMC 3366854 (freier Volltext).
- ↑ O. Musumeci, C. Bruno, T. Mongini, C. Rodolico, M. Aguennouz, E. Barca, A. Amati, D. Cassandrini, L. Serlenga, G. Vita, A. Toscano: Clinical features and new molecular findings in muscle phosphofructokinase deficiency (GSD type VII). In: Neuromuscular disorders (NMD), Band 22, Nummer 4, April 2012, S. 325–330, doi:10.1016/j.nmd.2011.10.022, PMID 22133655.
- ↑ D. B. Graham, C. E. Becker, A. Doan, G. Goel, E. J. Villablanca, D. Knights, A. Mok, A. C. Ng, J. G. Doench, D. E. Root, C. B. Clish, R. J. Xavier: Functional genomics identifies negative regulatory nodes controlling phagocyte oxidative burst. In: Nature Communications, Band 6, Juli 2015, S. 7838, doi:10.1038/ncomms8838, PMID 26194095, PMC 4518307 (freier Volltext).
- ↑ J. F. Koster, R. G. Slee, T. J. Van Berkel: Isoenzymes of human phosphofructokinase. In: Clinica Chimica Acta. Band 103, Nummer 2, April 1980, S. 169–173, doi:10.1016/0009-8981(80)90210-7, PMID 6445244.
- ↑ A. Elson, Y. Bernstein, H. Degani, D. Levanon, H. Ben-Hur, Y. Groner: Gene dosage and Down’s syndrome: metabolic and enzymatic changes in PC12 cells overexpressing transfected human liver-type phosphofructokinase. In: Somatic cell and molecular genetics. Band 18, Nummer 2, März 1992, S. 143–161, doi:10.1007/bf01233161, PMID 1533471.
- ↑ Gene: Pfkl. In: mousephenotype.org. International Mouse Phenotyping Consortium, abgerufen am 2. November 2019.
- ↑ Pfkltm1a(EUCOMM)Wtsi. In: informatics.jax.org. Mouse Genome Informatics, abgerufen am 2. November 2019.
- ↑ W. C. Skarnes, B. Rosen, A. P. West, M. Koutsourakis, W. Bushell, V. Iyer, A. O. Mujica, M. Thomas, J. Harrow, T. Cox, D. Jackson, J. Severin, P. Biggs, J. Fu, M. Nefedov, P. J. de Jong, A. F. Stewart, A. Bradley: A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function. In: Nature. Band 474, Nummer 7351, Juni 2011, S. 337–342, doi:10.1038/nature10163, PMID 21677750, PMC 3572410 (freier Volltext).
- ↑ E. Dolgin: Mouse library set to be knockout. In: Nature, Band 474, Nummer 7351, Juni 2011, S. 262–263, doi:10.1038/474262a, PMID 21677718.
- ↑ a b c A. K. Gerdin: The Sanger Mouse Genetics Programme: high throughput characterisation of knockout mice. In: Acta Ophthalmologica. Band 88, September 2010, S. 925–927, doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x.
- ↑ L. van der Weyden, J. K. White, D. J. Adams, D. W. Logan: The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism. In: Genome biology, Band 12, Nummer 6, Juni 2011, S. 224, doi:10.1186/gb-2011-12-6-224, PMID 21722353, PMC 3218837 (freier Volltext) (Review).